本校校徽於111年12月21日111 學年度第1次校務會議中通過，會議中決議後續關於LOGO 之產生方式，由校方行政團隊主導，參考最終獲選之校徽作品進行設計。
經行政團隊邀請本校專業領域教師數人，會同獲選校徽之原設計團隊，歷經6次提案會議討論，經共識產生以下識別標誌(LOGO)、標準字體(Wordmark)及色彩計畫(Color system)如下：

一、識別標誌（LOGO）：簡化字母轉折處，以更柔潤的筆劃使視覺平衡，更一致化的呈現。

二、校名標準字體（Wordmark）：校徽搭配之中文採孫文書法集字，乃考量孫文具有醫師身分，及其子孫科曾於民國17~19年擔任交通大學校長，藉以紀念兩校歷史。英文則選用 Albertus，根據在青銅板上刻的字設計簡化襯線特點，末端保留鑿線筆畫，介於古典字母和現代無襯線字體之間，以象徵原本兩校原有傳統之悠遠博厚。
LOGO為展現合校後之全新品牌形象，故搭配之中英字體則以清晰簡明、微調過的黑體，來呈現合校後的新氣象與未來感。

三、色彩計畫（color system）：主色為群青(Pantone 286C)，象徵理性冷靜 / 信任穩定 / 積極開拓 / 開放包容。輔色則建議採以黑/白/銀，相互搭配使用。

目前已完成相關應用項目為：畢業證書（於112年6月起發放）、名片、公文封等，其餘應用項目將陸續進行。